{"id":30111,"date":"2026-09-13T07:00:29","date_gmt":"2026-09-13T05:00:29","guid":{"rendered":"https:\/\/www.laterredufutur.com\/accueil\/?p=30111"},"modified":"2026-08-17T20:24:54","modified_gmt":"2026-08-17T18:24:54","slug":"un-monde-face-aux-bacteries","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.laterredufutur.com\/accueil\/un-monde-face-aux-bacteries\/","title":{"rendered":"Un monde face aux bact\u00e9ries"},"content":{"rendered":"<div class=\"1665f18d14f35dd9e7566e1a8ac9a3e9\" data-index=\"1\" style=\"float: none; margin:10px 0 10px 0; text-align:center;\">\n<script async src=\"https:\/\/pagead2.googlesyndication.com\/pagead\/js\/adsbygoogle.js\"><\/script>\r\n<ins class=\"adsbygoogle\"\r\n     style=\"display:block; text-align:center;\"\r\n     data-ad-layout=\"in-article\"\r\n     data-ad-format=\"fluid\"\r\n     data-ad-client=\"ca-pub-2860849627502538\"\r\n     data-ad-slot=\"3019501113\"><\/ins>\r\n<script>\r\n     (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});\r\n<\/script>\n<\/div>\n<h2>Une IA cr\u00e9e des virus capables de vaincre des bact\u00e9ries r\u00e9sistantes : une premi\u00e8re qui pourrait transformer la phagoth\u00e9rapie<\/h2>\n<p>L\u2019intelligence artificielle vient de franchir une nouvelle fronti\u00e8re dans le domaine de la biologie synth\u00e9tique. Des chercheurs de Stanford et de l\u2019Arc Institute sont parvenus \u00e0 concevoir, \u00e0 l\u2019aide de mod\u00e8les d\u2019IA, des g\u00e9nomes complets de bact\u00e9riophages \u2014 des virus sp\u00e9cialis\u00e9s dans l\u2019infection des bact\u00e9ries. Seize de ces virus artificiels se sont r\u00e9v\u00e9l\u00e9s fonctionnels en laboratoire et, plus \u00e9tonnant encore, un cocktail compos\u00e9 de ces phages a r\u00e9ussi \u00e0 vaincre des bact\u00e9ries devenues r\u00e9sistantes au virus naturel dont ils \u00e9taient inspir\u00e9s.<br \/>\nL\u2019\u00e9tude a \u00e9t\u00e9 publi\u00e9e le 6 ao\u00fbt 2026 dans la revue <em>Science<\/em>.<\/p>\n<h2>Quand l\u2019IA ne lit plus l\u2019ADN mais commence \u00e0 l\u2019\u00e9crire<\/h2>\n<p>Depuis plusieurs ann\u00e9es, les intelligences artificielles sont capables d\u2019analyser des g\u00e9nomes, de pr\u00e9voir la structure de prot\u00e9ines ou encore de proposer de nouvelles mol\u00e9cules.<\/p>\n<p>Cette fois, les chercheurs sont all\u00e9s beaucoup plus loin : ils ont demand\u00e9 \u00e0 des mod\u00e8les d\u2019IA sp\u00e9cialis\u00e9s, <strong>Evo 1 et Evo 2<\/strong>, de concevoir pratiquement de bout en bout le g\u00e9nome d&rsquo;un virus fonctionnel.<\/p>\n<p>Ces syst\u00e8mes fonctionnent d\u2019une mani\u00e8re comparable aux grands mod\u00e8les de langage utilis\u00e9s pour produire du texte. Mais au lieu d\u2019apprendre les relations entre des mots et des phrases, ils apprennent les r\u00e8gles statistiques qui organisent les s\u00e9quences d\u2019ADN.<\/p>\n<p>\u00c0 partir de millions de g\u00e9nomes, l\u2019IA apprend ainsi quelles combinaisons de nucl\u00e9otides peuvent permettre \u00e0 un organisme biologique de fonctionner.<\/p>\n<p>Le d\u00e9fi est consid\u00e9rable : modifier quelques g\u00e8nes est une chose, mais concevoir un g\u00e9nome entier suppose que des dizaines d&rsquo;interactions biologiques restent compatibles les unes avec les autres.<\/p>\n<h2>\u03a6X174, un minuscule virus devenu cobaye de l\u2019intelligence artificielle<\/h2>\n<p>Pour r\u00e9aliser leur exp\u00e9rience, les scientifiques ont choisi le bact\u00e9riophage <strong>\u03a6X174<\/strong>.<\/p>\n<p>Ce petit virus infecte certaines bact\u00e9ries <em>Escherichia coli<\/em> et poss\u00e8de un g\u00e9nome extr\u00eamement compact de seulement <strong>5 386 nucl\u00e9otides contenant 11 g\u00e8nes<\/strong>.<\/p>\n<p>Il occupe d&rsquo;ailleurs une place particuli\u00e8re dans l&rsquo;histoire de la g\u00e9n\u00e9tique : \u03a6X174 fut le premier organisme poss\u00e9dant un g\u00e9nome ADN enti\u00e8rement s\u00e9quenc\u00e9, en 1977.<\/p>\n<p>Sa petite taille et les connaissances accumul\u00e9es depuis des d\u00e9cennies en faisaient donc un candidat id\u00e9al pour tester la capacit\u00e9 de l\u2019IA \u00e0 concevoir un virus complet.<\/p>\n<p>Les chercheurs ont notamment sp\u00e9cialis\u00e9 leurs mod\u00e8les sur environ <strong>14 500 g\u00e9nomes de Microviridae<\/strong>, la famille \u00e0 laquelle appartient \u03a6X174.<\/p>\n<p><img data-recalc-dims=\"1\" loading=\"lazy\" decoding=\"async\" data-attachment-id=\"30114\" data-permalink=\"https:\/\/www.laterredufutur.com\/accueil\/un-monde-face-aux-bacteries\/virus-cree-par-ia-pour-detruire-bacteries\/\" 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biologiquement.<\/p>\n<p>Au total, <strong>285 g\u00e9nomes artificiels ont pu \u00eatre assembl\u00e9s et test\u00e9s exp\u00e9rimentalement<\/strong>.<\/p>\n<p>Le r\u00e9sultat a surpris les chercheurs.<\/p>\n<p><strong>Seize d&rsquo;entre eux ont produit des bact\u00e9riophages fonctionnels.<\/strong><\/p>\n<p>Ces virus \u00e9taient capables :<\/p>\n<ul>\n<li>d&rsquo;infecter leur bact\u00e9rie cible ;<\/li>\n<li>de s&rsquo;y multiplier ;<\/li>\n<li>de produire de nouvelles particules virales ;<\/li>\n<li>puis de provoquer la destruction de la bact\u00e9rie.<\/li>\n<\/ul>\n<p>Ils ne constituaient pas simplement des copies l\u00e9g\u00e8rement modifi\u00e9es de \u03a6X174. Certains pr\u00e9sentaient des centaines de diff\u00e9rences g\u00e9n\u00e9tiques par rapport aux virus naturels les plus proches.<\/p>\n<p>L&rsquo;un des phages g\u00e9n\u00e9r\u00e9s poss\u00e9dait par exemple seulement <strong>93 % d&rsquo;identit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique avec son parent naturel le plus proche<\/strong>, une divergence suffisamment importante pour \u00eatre comparable, selon certains crit\u00e8res taxonomiques, \u00e0 celle s\u00e9parant diff\u00e9rentes esp\u00e8ces virales.<\/p>\n<h2>Certains virus artificiels font m\u00eame mieux que la nature<\/h2>\n<p>Plus \u00e9tonnant encore : quelques-uns des phages g\u00e9n\u00e9r\u00e9s par l\u2019intelligence artificielle se sont r\u00e9v\u00e9l\u00e9s <strong>plus efficaces que \u03a6X174<\/strong> dans certaines exp\u00e9riences de laboratoire.<\/p>\n<p>Certains se reproduisaient davantage lorsqu&rsquo;ils \u00e9taient mis en comp\u00e9tition avec le virus naturel, tandis que d&rsquo;autres d\u00e9truisaient plus rapidement les cultures bact\u00e9riennes.<\/p>\n<p>L\u2019exp\u00e9rience montre ainsi quelque chose d\u2019essentiel : une IA ne se contente pas n\u00e9cessairement de reproduire les solutions d\u00e9j\u00e0 rencontr\u00e9es dans la nature.<\/p>\n<p>Elle peut explorer des combinaisons g\u00e9n\u00e9tiques diff\u00e9rentes et trouver des solutions biologiquement fonctionnelles qui n&rsquo;ont peut-\u00eatre jamais \u00e9t\u00e9 s\u00e9lectionn\u00e9es au cours de l&rsquo;\u00e9volution naturelle.<\/p>\n<p>Un phage baptis\u00e9 <strong>Evo-\u03a636<\/strong> illustre particuli\u00e8rement bien cette capacit\u00e9. L\u2019IA lui a attribu\u00e9 une prot\u00e9ine d&#8217;empaquetage de l&rsquo;ADN provenant d&rsquo;un phage relativement \u00e9loign\u00e9.<\/p>\n<p>Des biologistes avaient auparavant essay\u00e9 une modification comparable sans parvenir \u00e0 obtenir un virus fonctionnel.<\/p>\n<p>Cette fois, l&rsquo;ensemble du g\u00e9nome g\u00e9n\u00e9r\u00e9 par l\u2019IA contenait apparemment les adaptations n\u00e9cessaires pour que cette prot\u00e9ine puisse fonctionner correctement.<\/p>\n<h2>La d\u00e9couverte la plus prometteuse : contourner la r\u00e9sistance bact\u00e9rienne<\/h2>\n<p>L&rsquo;exp\u00e9rience devient particuli\u00e8rement int\u00e9ressante lorsqu&rsquo;on la rapproche de l&rsquo;un des grands probl\u00e8mes sanitaires du XXI\u1d49 si\u00e8cle : <strong>l\u2019antibior\u00e9sistance<\/strong>.<\/p>\n<p>Les bact\u00e9ries \u00e9voluent rapidement. Sous la pression des antibiotiques, certaines d\u00e9veloppent des mutations leur permettant de survivre.<\/p>\n<p>Une alternative possible consiste \u00e0 employer des bact\u00e9riophages pour les d\u00e9truire : c&rsquo;est la <strong>phagoth\u00e9rapie<\/strong>.<\/p>\n<p>Mais les bact\u00e9ries peuvent \u00e9galement devenir r\u00e9sistantes aux phages.<\/p>\n<p>Les chercheurs ont donc volontairement s\u00e9lectionn\u00e9 <strong>trois lign\u00e9es d&rsquo;E. coli devenues r\u00e9sistantes au bact\u00e9riophage \u03a6X174<\/strong>.<\/p>\n<p>Le virus naturel s&rsquo;est alors montr\u00e9 incapable de reprendre le dessus.<\/p>\n<p>En revanche, lorsque les scientifiques ont utilis\u00e9 <strong>un cocktail constitu\u00e9 des seize bact\u00e9riophages con\u00e7us par l&rsquo;IA<\/strong>, les trois populations bact\u00e9riennes r\u00e9sistantes ont finalement \u00e9t\u00e9 vaincues.<\/p>\n<p>Selon les chercheurs, le cocktail a surmont\u00e9 la r\u00e9sistance en <strong>un \u00e0 cinq passages exp\u00e9rimentaux selon la souche bact\u00e9rienne<\/strong>.<\/p>\n<p><img data-recalc-dims=\"1\" loading=\"lazy\" decoding=\"async\" data-attachment-id=\"30115\" data-permalink=\"https:\/\/www.laterredufutur.com\/accueil\/un-monde-face-aux-bacteries\/virus-cree-par-ia-pour-detruire-bacteries-2\/\" data-orig-file=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.laterredufutur.com\/accueil\/wp-content\/uploads\/2026\/09\/Virus-cree-par-ia-pour-detruire-bacteries-2.jpg?fit=1448%2C1086&amp;ssl=1\" data-orig-size=\"1448,1086\" data-comments-opened=\"0\" data-image-meta=\"{&quot;aperture&quot;:&quot;0&quot;,&quot;credit&quot;:&quot;&quot;,&quot;camera&quot;:&quot;&quot;,&quot;caption&quot;:&quot;&quot;,&quot;created_timestamp&quot;:&quot;0&quot;,&quot;copyright&quot;:&quot;&quot;,&quot;focal_length&quot;:&quot;0&quot;,&quot;iso&quot;:&quot;0&quot;,&quot;shutter_speed&quot;:&quot;0&quot;,&quot;title&quot;:&quot;&quot;,&quot;orientation&quot;:&quot;0&quot;,&quot;alt&quot;:&quot;&quot;}\" 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(max-width: 800px) 100vw, 800px\" \/><\/p>\n<h2>L\u2019IA fournit en quelque sorte des \u00ab munitions \u00bb \u00e0 l\u2019\u00e9volution<\/h2>\n<p>L\u2019explication est fascinante.<\/p>\n<p>En cr\u00e9ant simultan\u00e9ment de nombreux virus l\u00e9g\u00e8rement diff\u00e9rents, l\u2019IA augmente consid\u00e9rablement la diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique disponible.<\/p>\n<p>Les diff\u00e9rents phages peuvent ensuite \u00e9voluer, muter ou m\u00eame \u00e9changer certaines parties de leur g\u00e9nome par recombinaison.<\/p>\n<p>Les virus ayant finalement r\u00e9ussi \u00e0 contourner la r\u00e9sistance bact\u00e9rienne pr\u00e9sentaient justement des <strong>g\u00e9nomes mosa\u00efques<\/strong>, issus de plusieurs phages initialement dessin\u00e9s par l&rsquo;IA.<\/p>\n<p>L&rsquo;intelligence artificielle ne remplace donc pas ici l&rsquo;\u00e9volution.<\/p>\n<p>Elle lui fournit plut\u00f4t <strong>une immense biblioth\u00e8que de nouvelles possibilit\u00e9s g\u00e9n\u00e9tiques<\/strong>, sur laquelle la s\u00e9lection naturelle peut ensuite agir.<\/p>\n<p>Cette strat\u00e9gie pourrait un jour permettre de pr\u00e9parer rapidement des cocktails de bact\u00e9riophages destin\u00e9s \u00e0 une bact\u00e9rie particuli\u00e8re, avant m\u00eame que celle-ci n&rsquo;ait le temps de d\u00e9velopper une r\u00e9sistance durable.<\/p>\n<h2>Vers des traitements antibact\u00e9riens personnalis\u00e9s ?<\/h2>\n<p>\u00c0 long terme, cette technologie pourrait profond\u00e9ment modifier la phagoth\u00e9rapie.<\/p>\n<p>On peut imaginer qu&rsquo;apr\u00e8s avoir identifi\u00e9 la bact\u00e9rie responsable d&rsquo;une infection r\u00e9sistante, des syst\u00e8mes d&rsquo;IA puissent concevoir une famille enti\u00e8re de phages ciblant pr\u00e9cis\u00e9ment cette souche.<\/p>\n<p>Les chercheurs disposeraient alors de dizaines ou centaines de variantes susceptibles d&rsquo;attaquer diff\u00e9rents r\u00e9cepteurs bact\u00e9riens.<\/p>\n<p>Au lieu de rechercher dans la nature le bact\u00e9riophage id\u00e9al, il deviendrait th\u00e9oriquement possible de <strong>le concevoir sur mesure<\/strong>.<\/p>\n<p>Mais nous en sommes encore loin.<\/p>\n<p>L&rsquo;exp\u00e9rience publi\u00e9e dans <em>Science<\/em> reste avant tout une <strong>preuve de concept en laboratoire<\/strong>. Les bact\u00e9ries utilis\u00e9es \u00e9taient des souches exp\u00e9rimentales d&rsquo;<em>E. coli<\/em> et les phages n\u2019\u00e9taient pas destin\u00e9s \u00e0 infecter des cellules humaines.<\/p>\n<p>Il faudra encore v\u00e9rifier la s\u00e9curit\u00e9, l\u2019efficacit\u00e9 et le comportement de telles constructions dans des syst\u00e8mes biologiques beaucoup plus complexes avant d&rsquo;envisager une utilisation th\u00e9rapeutique.<\/p>\n<h2>Une avanc\u00e9e scientifique\u2026 qui pose aussi une question de bios\u00e9curit\u00e9<\/h2>\n<p>La capacit\u00e9 d&rsquo;une intelligence artificielle \u00e0 concevoir un g\u00e9nome viral fonctionnel soul\u00e8ve \u00e9videmment une autre question : <strong>jusqu&rsquo;o\u00f9 peut-on laisser une IA concevoir du vivant ?<\/strong><\/p>\n<p>Les chercheurs ont donc int\u00e9gr\u00e9 plusieurs garde-fous.<\/p>\n<p>Les phages \u00e9tudi\u00e9s infectent des bact\u00e9ries non pathog\u00e8nes de laboratoire et leur tropisme \u2014 c&rsquo;est-\u00e0-dire les organismes qu&rsquo;ils peuvent infecter \u2014 a \u00e9t\u00e9 fortement contraint.<\/p>\n<p>Les concepteurs d&rsquo;Evo 2 indiquent \u00e9galement avoir volontairement exclu de son entra\u00eenement les s\u00e9quences de virus infectant les cellules eucaryotes, ce qui limite notamment sa capacit\u00e9 \u00e0 g\u00e9n\u00e9rer des virus humains.<\/p>\n<p>Cette pr\u00e9caution n&rsquo;enl\u00e8ve cependant rien \u00e0 la question g\u00e9n\u00e9rale.<\/p>\n<p>Plus les mod\u00e8les biologiques progresseront, plus ils pourront explorer des g\u00e9nomes complexes.<\/p>\n<p>Les m\u00eames technologies capables de concevoir de nouveaux m\u00e9dicaments, enzymes ou bact\u00e9riophages pourraient donc potentiellement pr\u00e9senter des risques si elles \u00e9taient utilis\u00e9es sans contr\u00f4le.<\/p>\n<h2>Une nouvelle \u00e9tape dans l&rsquo;histoire de la biologie<\/h2>\n<p>L&rsquo;histoire du bact\u00e9riophage \u03a6X174 r\u00e9sume presque \u00e0 elle seule l&rsquo;\u00e9volution de la g\u00e9n\u00e9tique moderne.<\/p>\n<p>En <strong>1977<\/strong>, l&rsquo;humanit\u00e9 apprend \u00e0 lire enti\u00e8rement son g\u00e9nome.<\/p>\n<p>Quelques d\u00e9cennies plus tard, les biologistes apprennent \u00e0 synth\u00e9tiser chimiquement des g\u00e9nomes.<\/p>\n<p>Et aujourd&rsquo;hui, une intelligence artificielle commence \u00e0 en <strong>concevoir de nouveaux<\/strong>.<\/p>\n<p>La diff\u00e9rence est fondamentale.<\/p>\n<p>Nous passons progressivement d&rsquo;une biologie dans laquelle l&rsquo;homme observe et modifie le vivant \u00e0 une biologie o\u00f9 des syst\u00e8mes artificiels peuvent proposer eux-m\u00eames de nouvelles architectures g\u00e9n\u00e9tiques.<\/p>\n<p>Les seize bact\u00e9riophages obtenus ne constituent pas encore un m\u00e9dicament miracle contre les bact\u00e9ries r\u00e9sistantes.<\/p>\n<p>Mais ils d\u00e9montrent que l&rsquo;intelligence artificielle est d\u00e9sormais capable de g\u00e9n\u00e9rer des <strong>g\u00e9nomes viraux complets et fonctionnels<\/strong>, puis de produire une diversit\u00e9 suffisamment importante pour permettre \u00e0 ces virus de contourner certaines r\u00e9sistances bact\u00e9riennes.<\/p>\n<p>Et si cette capacit\u00e9 peut \u00eatre ma\u00eetris\u00e9e et encadr\u00e9e, elle pourrait devenir l&rsquo;un des outils les plus puissants de la future lutte contre les infections r\u00e9sistantes aux antibiotiques.<\/p>\n<p>Adaptation Terra Projects&nbsp;<\/p>\n<h3><em>Sources<\/em><\/h3>\n<p><em>\u00c9tude scientifique : S. H. King et collaborateurs, Generative design of bacteriophages with genome language models, <strong>Science<\/strong>, vol. 393, publi\u00e9e le 6 ao\u00fbt 2026, DOI 10.1126\/science.aec2657.<\/em><\/p>\n<p><em>Arc Institute \/ Stanford : pr\u00e9sentation de la conception et de la validation exp\u00e9rimentale des bact\u00e9riophages g\u00e9n\u00e9r\u00e9s par Evo 1 et Evo 2.<\/em><\/p>\n<p><em>Amphisciences, article du 15 ao\u00fbt 2026 consacr\u00e9 aux seize phages fonctionnels et \u00e0 leur capacit\u00e9 \u00e0 contourner la r\u00e9sistance bact\u00e9rienne.<\/em><\/p>\n<p class=\"bawpvc-ajax-counter\" data-id=\"30111\">(1)<\/p>\n<!--CusAds0-->\n<div style=\"font-size: 0px; height: 0px; line-height: 0px; margin: 0; padding: 0; clear: both;\"><\/div>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Une IA cr\u00e9e des virus capables de vaincre des bact\u00e9ries r\u00e9sistantes : une premi\u00e8re qui pourrait transformer la phagoth\u00e9rapie L\u2019intelligence&#8230;<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":30115,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_exactmetrics_skip_tracking":false,"ngg_post_thumbnail":0,"_jetpack_newsletter_access":"","_jetpack_dont_email_post_to_subs":false,"_jetpack_newsletter_tier_id":0,"_jetpack_memberships_contains_paywalled_content":false,"_jetpack_feature_clip_id":0,"_jetpack_memberships_contains_paid_content":false,"footnotes":"","jetpack_publicize_message":"","jetpack_publicize_feature_enabled":true,"jetpack_social_post_already_shared":true,"jetpack_social_options":{"image_generator_settings":{"template":"highway","default_image_id":0,"font":"","enabled":false},"version":2},"jetpack_post_was_ever_published":false},"categories":[18,8194],"tags":[3054,745,130,135,1066],"class_list":["post-30111","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-monde-futur","category-technologie","tag-bacterie","tag-ia","tag-monde","tag-technologie","tag-virus","wpcat-18-id","wpcat-8194-id"],"jetpack_publicize_connections":[],"jetpack_shortlink":"https:\/\/wp.me\/p631RN-7PF","jetpack-related-posts":[{"id":19349,"url":"https:\/\/www.laterredufutur.com\/accueil\/les-antibiotiques-peuvent-transformer-une-grippe-ordinaire-en-une-maladie-mortelle\/","url_meta":{"origin":30111,"position":0},"title":"Les antibiotiques peuvent transformer une grippe ordinaire en une maladie mortelle","author":"Admin","date":"6 ao\u00fbt 2019","format":false,"excerpt":"L'utilisation abusive d'antibiotiques a d\u00e9j\u00e0 entra\u00een\u00e9 l'\u00e9mergence d'un grand nombre de bact\u00e9ries r\u00e9sistantes aux antibiotiques qui pourraient menacer la sant\u00e9 future de l'esp\u00e8ce humaine. 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